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Laboratorio 1 - Slides
- Introduzione
- Algoritmo
- Pseudocodice
- Linguaggio di Programmazione
- python
- IDLE
- Variabili
- Stringhe
- Funzioni print/input
- Variabili booleane
- Liste, Insiemi e Dizionari
- Programmazione imperativa
- Scelta
- Ripetizione
- Scrivere e leggere da file
Laboratorio 2 - Slides
- DNA: nucleotidi e strand
- Reverse&Complement
- Formato FASTA
- Funzioni in python
- Sintesi delle proteine
- File di input: sequenze.fa (file di test più piccolo: sequenze.test.fa).
- Dizionario del codice genetico (esercizio 7):
CODON = {'ATA':'I', 'ATC':'I', 'ATT':'I', 'ATG':'M',
'ACA':'T', 'ACC':'T', 'ACG':'T', 'ACT':'T',
'AAC':'N', 'AAT':'N', 'AAA':'K', 'AAG':'K',
'AGC':'S', 'AGT':'S', 'AGA':'R', 'AGG':'R',
'CTA':'L', 'CTC':'L', 'CTG':'L', 'CTT':'L',
'CCA':'P', 'CCC':'P', 'CCG':'P', 'CCT':'P',
'CAC':'H', 'CAT':'H', 'CAA':'Q', 'CAG':'Q',
'CGA':'R', 'CGC':'R', 'CGG':'R', 'CGT':'R',
'GTA':'V', 'GTC':'V', 'GTG':'V', 'GTT':'V',
'GCA':'A', 'GCC':'A', 'GCG':'A', 'GCT':'A',
'GAC':'D', 'GAT':'D', 'GAA':'E', 'GAG':'E',
'GGA':'G', 'GGC':'G', 'GGG':'G', 'GGT':'G',
'TCA':'S', 'TCC':'S', 'TCG':'S', 'TCT':'S',
'TTC':'F', 'TTT':'F', 'TTA':'L', 'TTG':'L',
'TAC':'Y', 'TAT':'Y', 'TAA':'$', 'TAG':'$',
'TGC':'C', 'TGT':'C', 'TGA':'$', 'TGG':'W'}
Laboratorio 3 - Slides
- Esercizi di ripasso per python
Laboratorio 4 - Slides
- Classi in python
- Sequenziamento e formato FASTQ