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Análise de dados de medidas de ângulos de torção femoral e impactos fêmoro-acetabulares

License: GNU General Public License v2.0

R 98.90% Rebol 1.10%
linear-regression orthopedic-surgery hip cross-sectional

analise_dados_fp_2017's Introduction

Análise de Dados projeto Fernando Pina (INTO-2017)

Análise de dados de medidas de ângulos de torção femoral e impactos fêmoro-acetabulares

Análises realizadas

  1. Análise qualitativa dos impactos fêmoro-acetabulares (Planejamento)
  2. Análise quantitativa da torção femoral (Planejamento)
  3. Análise qualitativa da torção femoral (Planejamento)

Relatório da análise de dados

Ver as etapas desta análise.

Versão 01 - Qualificação - Concluído em 26/07/2018.

Planejamento.

Versão 02 - Defesa - Concluído em 09/11/2018.

Planejamento.

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analise_dados_fp_2017's Issues

versão final das figuras

  • Definir tamanho adequado para cada figura estática
  • Axis labels, e títulos
  • Definir tema padronizado para figuras (background, paleta, etc)

Tabela 1

Foi apontado pela banca que a comparação mais informativa da tabela 1 seria por grupo, e não por gênero.

Talvez ainda seja relevante apresentar as proporções de dor por lateralidade.

Tabela de %CV de Torção e Alfa

Ao invés de exibir o resultado da diferença de variabilidade relativa dos ângulos em forma visual ( #28 ), é mais impactante exibir em forma de tabela.

Criar como tabela 3 na seção de análise descritiva

atualizar metodologia para novos modelos qualitativos

A metodologia permaneceu com a descrição dos dados

  • por pacientes, ao invés de quadris afetados
  • desfecho como lado acometido

Atualizar a descrição dos modelos de regressão logística e multinomial para os novos desfechos considerados.

Incorporar texto da qualificação no report

Para facilitar a escrita colaborativa, o texto dos resultados do report deve ser semelhante ao texto da dissertação. Isso vai simplificar a identificação dos trechos modificados ou adicionados.

Obs: O report continua sendo um documento independente da dissertação. O objetivo desta issue é apenas facilitar a colaboração, e não reproduzir aqui o texto da dissertação.

fechamento v02

  • atualizar figuras
  • atualizar histórico do report
  • gerar DOCX e PDF
  • atualizar README
  • release v02

Comentar sobre variabilidade Torção e Alfa

Uma explicação possível para a baixa taxa de sinal/ruído no ângulo de torção é a sua grande variabilidade relativa, quando comparada com o ângulo alfa. Isto deve ser explicitamente observado no report

associar torção femoral a impacto fêmoro-acetabular

IMPACTO = (ângulos alfa e/ou índice acetabular<0 / índice de extrusão > 39)

Criar modelos para avaliar a associação do tipo de impacto com

  • o ângulo de torção mensurado ( lm)
  • se a torção é alterada (glm)
  • o tipo de alteração da torção (multinom)

Boxplot das variabilidades Torção E Alfa

Para auxiliar a descrição da diferença das variabilidades das quantvars ( #14 ), criar uma figura com os boxplots dos ângulos Alfa e de Torção femoral.

Esta etapa vai justificar o resultado a ser descrito em #10

Hipótese: MISTO (CAM + PINCER) não é o mais comum

Uma hipótese na literatura é de que a ocorrência de CAM+PINCER (MIXED) é "o mais comum" (presumivelmente comparado com a ocorrência de apenas um deles.

FP tem a hipótese de que não é o mais prevalente. Testar esta hipótese.

Escrever Metodologia

Planejar e escrever a metodologia de análise dos dados, para cada pergunta a ser respondida.

Corrigir barplot dos impactos

A figura dos impactos causou confusão pois não ficou claro o que está sendo exibido.

Usar a coluna IMPACTO ao invés de cada coluna individual, para ter a separação entre cada diagnóstico de quadril.

usar figuras estáticas no report

A visualização online do report não contém as figuras (dinâmicas), e não vale a pena salvar a versão "online" pois é duplicar a figura já salva.

Usar no report as figuras já salvas, ao invés de usar figuras dinâmicas em chunks.

Contexto da análise

Falta uma descrição mínima do contexto e objetivos da análise no report. Preencher introdução.

cabeçalho do report

O cabeçalho do report v01 está em branco. Escrever

  • título
  • destinatário
  • data

Frequências dos impactos estão erradas

A solução da #55 não foi propagada para o texto, portanto a #56 está errada. Os impactos devem ser contabilizados considerando o diagnóstico de cada quadrll, e não as proporções independentes de ocorrência de cada tipo de impacto.

Usar dados.impacto (N=50), coluna IMPACTO.

Entrada do repositório

Popular o README do repositório com

  • o contexto da análise ( #18 )
  • link para o report visualização ( #12 )
  • link para o report em DOCX

Declarar números dos impactos

A seção de impactos declara apenas as diferenças, e razões de chance. Incluir também os números de impactos em cada resultado.

Bar plots: usar escala percentual

O próprio discente ficou com dificuldade em compreender as relações (e.g.) entre as frequências dos tipos de impacto, na figura mais simples, pois os N não somam 52.

A visualização portanto não está tornando evidente que cada barra é relativa ao N total. Usar escala em % é uma opção simples de corrigir esse defeito de comunicação.

incorporar resultados dos impactos

A versão atual do rascunho ficou sem texto da seção dos impactos, somente com os p-valores. Após múltiplas reuniões, temos uma versão de descrição desses resultados. Esse material deve entrar no report v01

Tabela 1 sem estratificação

Agora que a tabela 1 é segregada por grupo, a legenda não condiz mais com a descrição dos participantes. Juntar com a tabela 2 descrevendo os quadris.

Após comunicação por e-mail, FP concordou em gerar a tabela 1 dos participantes, sem estratificar, i.e., apenas as descrições gerais.

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