When a prescription is checked, save in prescriptionSnapshot table a snapshot of all risk variable in at the moment of check.

... in several places...

Background

NoHarm's backend code today doesn't have much testing (neither unitary nor acceptance). To start increasing code test coverage, let's start with the broader endpoint acceptance tests.

Task Goal

Develop basic acceptance tests for memory endpoints:

• GET /memory/string:kind
• PUT /memory/
• PUT /memory/int:idMemory

Getting Memory List (GET)

This endpoint get a list of records from memory table with a certain kind. It could be one record or many records.

Steps of Acceptance Test

1. Authenticate in the system with demo user;
2. Call an existing memory;
3. Basic checks:
   - assert status code auth
   - assert memory key
   - assert memory value

Set a new Memory (PUT)

This endpoint set a new memory record with a specific kind.

Steps of Acceptance Test

1. Authenticate in the system with demo user;
2. Set a new memory;
3. Basic checks:
   - assert status code

Update a existing Memory (PUT)

This endpoint set a existing memory record with a specific kind.

Steps of Acceptance Test

1. Authenticate in the system with demo user;
2. Update a existing memory;
3. Basic checks:
   - assert status code
   - assert memory id

Update a non-existing Memory (PUT)

Try to update a memory that do not exist in the memory table.

Steps of Acceptance Test

1. Authenticate in the system with demo user;
2. Update a non-existing memory;
3. Basic checks:
   - assert status error code

Reference

The is some GET and POST tests to use as reference such as Patient Test in test folder.

Substituir o readcsv do pandas por uma função:

https://github.com/noharm-ai/backend/blob/master/routes/outlier_generate.py#L123

https://github.com/noharm-ai/backend/blob/master/routes/outlier_lib.py#L2

Sobre a NoHarm

A NoHarm é uma startup sem fins lucrativos que desenvolve tecnologia para segurança do paciente. Oferecemos nosso produto de forma gratuita para o SUS, uma maneira de criar uma tecnologia inclusiva. Saiba mais sobre nossa arquitetura e infraestrutura na nossa Política de Dados.

Contribuindo para a NoHarm

Estamos felizes em aceitar suas contribuições para tornar a NoHarm melhor e mais incrível! Para evitar trabalho desnecessário em qualquer lado, siga o seguinte processo:

1. Verifique se já existe [um problema] (https://github.com/noharm-ai/backend/issues) que te interesse.
2. Se não houver, abra um novo para iniciar uma discussão.
3. Faça um Fork do nosso repositório e execute as alterações que achar importantes. Se precisar, use nossa imagem docker para montar o ambiente de desenvolvimento
4. Depois do código alterado, fala um Pull Request para o branch develop para testar as suas alteração.
5. Se estiver tudo certo, ficaremos felizes em fazer o merge da sua contribuição;

Caso você queira apenas ajudar e não saiba por onde começar, pode sugerir a criação de um test unitário para alguma função do backend ou resolver algum bug que tenha encontrado.

Diretrizes do Git Commit

Se já existe um ticket, use este número no início de sua mensagem de confirmação.
Use mensagens de confirmação significativas que descrevam o que você fez.

** Exemplo: ** `GH-42: Novo teste unitário para a função get_patients;

Se tiver dúvidas, entre em contato: [email protected]

Implement Read-Only Session from Replica DB
https://gist.github.com/jasonwalkeryung/5133383d66782461cdc3b4607ae35d98

• Separar atributos de alerta dos medicamentos por segmento;
  • Novos atributos: Divisor De Faixas (integer), Considerar Peso (boolean)
  • Separar atributos dos medicamentos por segmento;
• Alterar alerta função hepática: Trocar verdadeiro ou falso por número;
• Alerta Hepático somente para valores acima da referência;
• Trazer nome do Segmento no endpoint da Prescrição;

Background

There is some acceptance tests for drugs endpoint, but we can improve it.

Task Goal

Improve acceptance tests for drugs endpoints:

• GET /drugs/int:idSegment improve test_get_drugs_by_idSegment
• GET /drugs/int:idSegment with q param
• PUT /drugs/int:idDrug

The drugs endpoint definition are in outlier.py file

Getting Drug List by Segment (GET)

Improve test_get_drugs_by_idSegment

Add new asserts to test_get_drugs_by_idSegment

1. Keep the tests and...
   • assert drugs count

Getting Drug List by Query (GET)

This is a new test fuction

Add new asserts to test_get_drugs_by_idSegment

1. Search drug name using q param:
   - assert drugs count

Set drug properties (PUT)

This is a new test fuction

Steps of Acceptance Test

1. Authenticate in the system with demo user;
2. Set a drug properties;
3. Basic checks:
   - assert status code
   - assert drug.liver
   - assert drug.chemo
   - assert other properties

Can Amazon ElastiCache improve the system performance at some endpoints?

Desenvolver testes unitários para as funções de Memória da API

/memory/string:kind GET
/memory/int:idMemory PUT

Upgrade to SQLAlchemy 1.4.x
Special care with schema change in the same session.

Upgrade flask and deprecated flask-api

• Novo Endpoint: /exams/{admissionNumber} GET
  • Lista dos exames: [ { name, date, value, ref, alert, history[exams] } , ...]
• Possibilidade de Edição do Peso do Paciente
  • Novo Endpoint: /patient/{admissionNumber} POST
  • Atualização dos Outliers?
• Novo indicador de medicamento por peso no endpoint: {useWeigth}
• Novos dados no endpoint da prescrição: {bed, record}
• Nova opção de filtro na Triagem por Medicamento
• Não contar nos indicadores os medicamentos suspensos;
• Alerta de Alergias;
• Sinalização que paciente mudou de setor;

Para evitar o overhead de prescrições de itens no CPOE, deve haver um método para calcular a prescrição agrupada através do número do atendimento.