mauromardones / erizo_65_21

SA Erizo X y XI regiones Año 2021 (Serie larga)

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PBRs_Erizo

Este repositorio contiene los análisis realizados para el cálculo de PBRs para las unidades de stock del Erizo.

Descripción del contenido de la carpeta "codigos_admb"

El código base corresponde a un Modelo de Captura a la talla ("Modbento") creado por [email protected]. Los códigos utilizados para este estudio corresponde a una modificación del "Modbento". Esta modificación es realizada por [email protected] y [email protected] se detallará a continuación.

Contiene los códigos de ADMB principalmente MAET.tpl y MAET.dat del modelo de evaluación de stock de erizo de la zona X Norte (MAETXN) , X Sur (MAETXS) y XI (MAETXI).

Los modelos corresponden a modelos anuales (año calendario) con dinámica a la edad e información en tallas (utiliza matriz de probabilidad edad_talla).

Los principales datos que ingresan al modelo corresponden a los desembarques, CPUE y frecuencia de tallas de la flota. Utiliza un vector de pesos medios a la talla, madurez a la talla, y parámetros de crecimiento y mortalidad natural.

CARPETAS:

1. codigos_admb

• código fuente (.tpl)

• datos y controles (.dat)

2. funciones

• Fn_Retrospectivo.R = Retrospectivo (genera la carpeta con archivos admb)

• functions.R = lisread (función que lee archivo ".dat") y reptoRlist (función que lee archivo ".rep")

Códigos en Rmarkdown

• Informe_Estatus_Erizo_word.Rmd = corresponde al informe de estatus del las tres unidades de stock del erizo que debe ser entregado entre diciembre y enero.

• Erizo.Rmd = contendrá los análisis exploratorios y cálculo de PBRs

Archivos:

• Informe_Estatus_Erizo_word.docx = es la salida del código .Rmd con el mismo nombre

• TemplateWord_Erizo.docx = es utilizado en el código "Informe_Estatus_Erizo_word.Rmd" para darle el formato deseado (tipo de letra, títulos, etc).

• Readme_codADMB.pdf = se describen los archivos de datos y controles (.dat), reporte (.rep), el código fuente (.tpl), los parámetros estimados por el modelo (.par) y parámetros y variables estimadas con error (.std).