lucaangioloni / fit-covid19

Easy model to fit logistic curve to COVID19 data from Italy. Demo: https://fit-covid19.herokuapp.com

fit-COVID19

Easy model to fit logistic curve to COVID19 data from Italy.

Data is taken from this official repo

Live demo: https://fit-covid19.herokuapp.com (It could be slow because it is a free heroku app)

For single regions: https://fit-covid19.herokuapp.com/regione/nome

(Ex. Toscana: https://fit-covid19.herokuapp.com/regione/Toscana)

Predictions for Italy:

usage: fit.py [-h] [--img IMG] [--avg AVG] [--style STYLE]

Modello COVID-19 in Italia.

optional arguments:
  -h, --help  show this help message and exit
  --img IMG   y, save imgs - n do not save imgs
  --avg AVG      if > 1 draw plot of avg last --avg days.
  --style STYLE  [normal, cyberpunk] : normal, standard mpl - cyberpunk,
                 cyberpunk style
  --old_pred OLD_PRED  if True plot also the prediction curve from a week ago.

Predictions for a region:

usage: regione_fit.py [-h] --regione REGIONE [--img IMG] [--avg AVG] [--style STYLE]

Modello COVID-19 per regione.

optional arguments:
  -h, --help         show this help message and exit
  --regione REGIONE  Nome regione su cui effettuare le predizioni.
  --img IMG          y, save imgs - n do not save imgs
  --avg AVG      if > 1 draw plot of avg last --avg days.
  --style STYLE  [normal, cyberpunk] : normal, standard mpl - cyberpunk,
                 cyberpunk style
  --old_pred OLD_PRED  if True plot also the prediction curve from a week ago.

Examples

If you know this stuff and you think you can contribute please just let me know: fork this repo, pull request, star this repo, send me an email.

Requirements

• Python >=3
• Pandas
• Numpy
• ScyPy

fit-covid19's Issues

nuovi contagi

ho chiesto direttamente alla protezione civile, questa la risposta

pcm-dpc/COVID-19#294 (comment)

spero di essere di aiuto.

Aggiungere media a 3 e 7 giorni

Come da titolo, si potrebbe aggiungere la possibilità di generare i grafici con media a 3 e a 7 giorni

Nuovi contagiati sono in realtà Attualmente positivi

Buongiorno, grazie per il tuo lavoro e interessante visualizzazione. Credo dai numeri che il grafico Nuovi contagiati sia in realtà gli attualmente positivi.
Grazie e stiamo a casa.

Predizione su attualmente positivi

Ciao Luca,

Volevo innanzitutto farti i complimenti per l'ottimo lavoro. Volevo chiederti come mai non è stata implementato il fitting della gaussiana sulla curva degli attualmente positivi. Ho provato a farlo e ottengo qualcosa di simile a questo:

Ho dovuto rimuovere il bounds e p0 iniziali della funzione curve_fit, pensi possa essere ugualmente accurato?