gabrielgesteira / mimulus-qtl

QTL Mapping (IM and CIM) of Mimulus sp.

Escola Superior de Agricultura “Luiz de Queiroz”

Programa de Pós graduação em Genética e Melhoramento de Plantas

Disciplina: Biometria de Marcadores Genéticos

Alunos:

• Emanoel Martins
• Gabriel Gesteira
• Jackeline Borba
• Pedro Barbosa

Mapeamento de QTLs - Mimulus spp.

A proposta deste trabalho foi realizar o mapeamento de QTLs em Mimulus spp., com base em um mapa genético elaborado anteriormente utilizando o software Onemap. Para o mapeamento de QTLs foram utilizados dados genotípicos obtidos de 418 marcadores moleculares e dados fenotípicos coletados em campo para o caráter 'número de pólens não-viáveis'. Os métodos empregados foram o mapeamento por intervalo (Interval Mapping - IM) e mapeamento por intervalo composto (Composite Interval Mapping - CIM), com o auxílio do software estatístico R/qtl.

Clique aqui para visualizar o script utilizado e os resultados obtidos com as análises, ou aqui para visualizar o mapa com o QTL posicionado.

Vídeo: passo-a-passo

Disponibilizamos um vídeo no YouTube onde detalhamos por etapas os procedimentos realizados para o mapeamento dos QTLs. Para visualizar o vídeo, clique aqui.