Можно сделать вывод, что в каждом случае подрезание значительно улучшило характеристики.
Summary до подрезания:
Summary после подрезания:
Summary до подрезания:
Summary после подрезания:
Summary до подрезания:
Summary после подрезания:
total reads | aligned 0 times | aligned exactly 1 time | aligned >1 times | |
---|---|---|---|---|
ENCFF278SGU (реплика 1) | 35055488 | 28094377 (80.14%) | 1866036 (5.32%) | 5095075 (14.53%) |
ENCFF367OLH (реплика 2) | 33363869 | 29955291 (89.78%) | 1002075 (3.00%) | 2406503 (7.21%) |
ENCFF969KKW (контроль) | 56384154 | 51037733 (90.52%) | 1576025 (2.80%) | 3770396 (6.69%) |
Можно заметить, что т.к. выравнивание было на одну хромосому, то пиков вышло довольно мало, а соответственно и пересечений. В ENCODE в свою очередь пики присутствуют для всех хромосом.