生物先端科学コース 学生実験 [2023年度 前期]
事前準備
- インターネットブラウザ
- 対応ブラウザ
- Google Chrome
- FireFox
- Safari
- Microsoft Edge
- 非対応ブラウザ(利用不可)
- Internet Explorer
- 対応ブラウザ
- Googleアカウント(無料アカウントでOK)
- 持っていない場合は以下を参考に作成してください
- Googleアカウント作成ページ
テキスト
ゲノム情報解析入門 [2022年度 学部講義]
- 時間:毎週火曜 14:45 - 16:15
- シラバス
必要なもの
実習では、Google Colaboratoryを使います。
- インターネットブラウザ
- 対応ブラウザ(推奨)
- Google Chrome
- FireFox
- Safari
- 非推奨ブラウザ(動作検証されていない)
- Microsoft Edge
- 非対応ブラウザ(利用不可)
- Internet Explorer
- 対応ブラウザ(推奨)
- Googleアカウント(無料アカウントでOK)
- 持っていない場合は以下を参考に作成してください
- Googleアカウント取得方法
解析実習表
各回の授業開始前までに、Googleアカウントへの ログイン を済ませ、このページを開いておいてください。
No. | 実習内容 | 日付 | 資料 | その他 |
---|---|---|---|---|
01 | 講義についての説明 | 10月4日 | 課題 | |
02 | Google Colaboratoryの使い方 | 10月11日 | テキスト 課題 |
Q&A |
03 | DNAシーケンス | 10月18日 | 課題 | |
04 | DNAシーケンス/ゲノムアセンブリ | 11月1日 | 課題 | |
05 | QTL-seq入門(1) 参照配列の準備 | 11月8日 | テキスト 課題 課題解答例 |
Q&A |
06 | QTL-seq入門(2) リードアライメント、SNP検出 | 11月15日 | テキスト 課題 課題解答例 |
Q&A |
07 | QTL-seq入門(3) SNP-indexの算出、グラフ描画 | 11月29日 | テキスト 課題 課題解答例 |
Q&A |
08 | GWAS基礎 | 12月6日 | テキスト 課題 課題解答例 |
Q&A |
09 | Genomic Prediction (1) | 12月13日 | テキスト 課題 課題解答例 |
Q&A |
10 | Genomic Prediction (2) | 12月20日 | テキスト 課題 |
Q&A |
11 | RNA-seq (1) | 1月17日 | テキスト 課題 |
Q&A |
12 | RNA-seq (2) | 1月24日 | テキスト 課題 |
Q&A |
13 | Gene function | 1月31日 | テキスト 課題 |
|
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実習内容は、進捗状況により変更することがあります。
各回の課題は、講義終了後 (16:15頃)にアップロードいたします。
出欠確認方法
各回の課題の提出状況により出欠確認をいたします。
課題未提出の場合、欠席扱いになりますのでご注意ください。
課題提出方法
各回の課題は、PandA を使って提出してください。
提出方法の詳細は、各課題ページに記載いたします。
講義で紹介した書籍やサイトなど
過去の年度のテキスト
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