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Datos y análisis cobre el COVID-19 en México. https://coronamex.github.io

Datos sobre el COVID-19 en méxico.

IMPORTANTE: A partir del 2020-04-13 la Secretaría de Salud ha comenzado a publicar información más completa del COVID-19 en la plataforma de datos abiertos del gobierno. Se espera que estos datos se actualicen diariamente. Estos datos se encuentran en el directorio datos_abiertos de este repositorio, y tomarán precendencia para los análisis y visualizaciones en CoronaMex. Sin embargo, se siguen recolectando los datos de los reportes diarios mientras el gobierno los siga publicando.

Este repositorio contiene los datos presentados en CoronaMex.

Los siguientes directorios están presentes:

• demograficos: Datos demográficos de diversas fuentes. Revizar el archivo demograficos/README.md para más detalles.
• datos_abiertos: Datos liberados por la Secretaría de Salud a partir del 2020-04-13 en la plataforma de datos abiertos. Estos datos toman precedencia para los análisis de CoronaMex. El archivo datos_abiertos/README.md describe los datos disponibles.
• sinave: Archivos PDF del Boletín Epidemiológico del Sistema Nacional de Vigilancia Epidemiológico (SINAVE), que la Dirección General de Epidemiología publica cada semana (con dos semanas de retraso). Además, se convierte a formato CSV la tabla de enfermedades respiratorias infecciosas de los boletines. La Secretaría de Salud usa el número de casos a nivel nacional de estas enfermedades para estimar un factor de corrección y convertir el número de casos de COVID-19 en las USMER en un estimado de casos de COVID-19 a nivel nacional (sistema Centinela). NOTA: los números en estas tablas no concuerdan con las tablas mostradas en las conferencias de prensa de la Secretaría de Salud, posiblemente porque los boletines incluyen casos probables.
• src: Código para procesar datos.
• ssa_dge_2020-04-19: Después de 2020-04-19 la DGE ya sólo publica un PDF con una captura del mapa nacional de incidencia. Se almacena el PDF pero las tablas ya no se actualizan. Datos liberados por la Dirección General de Epidemiología de la Secretaría de Salud a través de sus comunicados técnicos diarios así como las tablas de casos confirmados y casos sospechosos del InDRE y liberados diariamente. También se obtienen datos del mapa interactivo de la DGE. El archivo ssa_dge_2020-04-19/README.md describe los datos disponibles. NOTA: Las tablas de casos confirmados y sospechosos dejaron de publicarse después del 2020-04-18.
• util: Archivos con utilidades para el código.

Acerca de este repositorio

Los datos aquí presentados son públicos y fueron recopilados por Sur Herrera Paredes de diversas fuentes. El código se distribuye bajo una licencia GPL-3 y la recopilación de datos bajo una licencia CC BY-NC 4.

Fuentes de datos

• Los comunicados técnicos diarios y las tablas de casos positivos y sospechosos que elabora el InDRE y publicados por la Dirección General de Epidemiología (DGE). La DGE tiene sus documentos más recientes en su sitio de COVID-19, y se pueden encontrar algunos de los archivos anteriores en su historial de documentos. Esta es una fuente oficial.
• El mapa interactivo de la DGE se usa para obtener datos por estado. Esta es una fuente oficial.
• El portal de datos abiertos del Gobierno de México y la página correspondiente de la Dirección General de Epidemiología publican una tabla en formato CSV desde el 2020-04-13. Esta es una fuente oficial.
• Repositorio de Guillermo de Anda-Jáuregui para completar tablas de casos confirmados. Esta es una fuente no oficial.
• Repositorio mexicovid19/Mexico-datos para completar tablas de casos confirmados y sospechosos. Esta es una fuente no oficial.
• Repositorio de Gabriel Alfonso Carranco-Sapiéns para completar tabla de casos confirmados. Esta es una fuente no oficial.

datos's Issues

2020-04-06 Cambio de formato en tabla casos positivos

Eliminaron columna de fecha de llegada.

Probablemente llevará a sobrestimar el número de casos de transmisión comunitaria.

Script necesita lidiar con la variación en el formato

Agregar num de casos estimados x Centinela al texto/ incrementar graduación eje Y

Hola Sur,

Felicidades de nuevo por la paǵina y por proveer de un valioso recurso para que todos los mantengamos informados. Tengo, un par de sugerencias sobre el formato de los gráficoss que compartes que podría ayudar a hacer más accesible la información.

Como lo menciono en el título la sugerencia es que en gráficas donde los ejes (particularlmente el Y) no contenga una graduación densa p.e. la gráfica de "¿Cuántos casos hay en México? (Centinela)". Una posible solución a ésto es poner el valor del estimado en el texto directamente, la otra sería incrementar un poco la graduación del eje "Y" para poder tener una idea del estimado de posibles casos de COVID-19 en México. Esta lógica podría aplicar a otras gráficas que tengan formato similar.

Sólo una sugerencia.

Saludos y muchas gracias de nuevo

Serie de tiempo por municipio de residencia

Añadir fecha de confirmación por estado en serie de tiempo por estado unidad médica

Incorporar datos 15 marzo, 17 marzo

Incorporar datos recolectados por guillermodeandajauregui.

Repositorio copiado en https://github.com/coronamex/datos_covid19.mx

Contiene PDF del InDRE del 15 de marzo y tabla CSV del 17 de marzo. Números coinciden con reportes técnicos diarios.

Eje Y de gráficas esta cortado

Hola Sur! Felicidades por la inciativa, esta muy buenas las gráficas. Las gráficas parecen estar cortadas hacia su extremo izquierdo, no se aprecian los ejes "y" de las mismas. Podŕia ser algo de las gráficas o que todo esta desfasado hacia la derecha?
Gracias y saludos